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棕竹炭疽病病原菌的分离鉴定

来源:六九路网
亚热带农业研究      

SubtropicalAgricultureResearch

樊改丽.棕竹炭疽病病原菌的分离鉴定[J].亚热带农业研究ꎬ2019ꎬ15(2):127-131.

 

第15卷第2期

2019年5月

FANGaili.IsolationandidentificationofpathogencausinganthracnoseonRhapisexcelsa[J].SubtropicalAgricultureResearchꎬ2019ꎬ15(2):127-131.

棕竹炭疽病病原菌的分离鉴定

樊改丽

(厦门市绿化中心/厦门市森林病虫害防治技术站ꎬ福建厦门361004)

摘要:[目的]明确引起棕竹叶片炭疽病的病原菌种类ꎮ[方法]通过常规组织分类法、形态学方法以及多基因系统发育方法对棕竹炭疽病进行分离鉴定ꎮ[结果]从棕竹病叶上分离的病原菌可以侵染有伤的棕竹叶片并引发炭疽病ꎻ多基因系统发育树分析表明ꎬ该病原菌与暹罗刺盘孢菌株聚为一类ꎮ[结论]引起棕竹炭疽病的病原菌为胶孢炭疽菌(Colletotrichumgloeosporioides)类群中的暹罗刺盘孢菌(C.siamense)ꎮ关键词:棕竹ꎻ炭疽病ꎻ病原菌ꎻ多基因系统发育树中图分类号:S432.1

文献标识码:A

文章编号:1673 ̄0925(2019)02 ̄0127 ̄05

DOI:10.13321/j.cnki.subtrop.agric.res.2019.02.010

IsolationandidentificationofpathogencausinganthracnoseonRhapisexcelsa

(XiamenGreeningAdministrationCenter/XiamenForestPestControlTechnologyStationꎬXiamenꎬFujian361004ꎬChina)Abstract:[Purpose]ToidentifythepathogencausinganthracnoseonRhapisexcelsa.[Method]Threemethodswereusedꎬinclu ̄dingtheconventionaltissueclassificationꎬmorphologicalphenotypingandmulti ̄genephylogenetictreeanalysis.[Result]Theisola ̄tedpathogencouldinfectthedamagedleavesofR.excelsaandcauseanthracnose.PolygenicphylogenetictreeanalysisfoundthatthewasC.siamense.

FANGaili

pathogenandColletorichumsiamenseweregroupedintoonebranch.[Conclusion]ThepathogencausinganthracnoseonR.excelsaKeywords:Rhapisexcelsaꎻanthracnoseꎻpathogenꎻpolygenicphylogenetictree

炭疽菌属(ColletotrichumCorda)真菌是一类分布广泛的植物病原菌ꎬ可危害橡胶树、茶树、茉莉、辣椒、芒果等上百种植物ꎬ是多种粮食作物及经济作物的重要致病菌ꎮ胶孢炭疽菌(C.gloeosporioides)复合种分为22个种和1个亚种[1]ꎬ暹罗刺盘孢菌(C.siamense)是胶孢炭疽菌复合种中的一种ꎬ2009年由Prihastuti引起的苹果[3]、草莓[4]、油茶[5]、海南台农芒果[6]、菠萝蜜[7]炭疽病等ꎮ

etal[2]从泰国健康咖啡浆果和病果上分离得到ꎮ由暹罗刺盘孢菌引起的经济作物炭疽病报道比较多ꎬ如

棕竹(Rhapisexcelsa)也称观音竹、棕榈竹等ꎬ原产于我国东南和西南地区ꎬ为棕榈科棕竹属的常绿丛

生灌木ꎮ现约有20种棕竹属植物ꎬ分为大叶棕竹、细叶棕竹、中叶棕竹、花叶棕竹和多裂棕竹等[8]ꎮ近年来ꎬ棕榈科植物种植越来越广泛ꎬ随之而来的棕竹病害发生也逐渐增加[9]ꎮ棕竹病害的发生不仅严重影及防治的研究鲜见报道ꎮ

本文对厦门市植物园、公园及道路绿化带常见的棕竹叶斑病进行采样ꎬ采用形态学特征与分子系统发育相结合的方法进行分离鉴定ꎬ以期为棕竹炭疽病的化学防治及生物防治提供参考ꎮ

收稿日期:2019-03-23

基金项目:福建省住房和城乡建设厅(2017 ̄K ̄90)ꎻ厦门市科技惠民项目(3502Z20174056)资助ꎮ

第一作者简介:樊改丽(1984—)ꎬ女ꎬ博士ꎮ研究方向:植物保护、林业检疫性有害生物防治和园林病虫害防治ꎮEmail:fangaili2003@163.comꎮ

响了棕竹的健康生长和观赏价值ꎬ同时对其他棕榈科植物造成潜在危险ꎮ而当前有关棕竹病害分离鉴定

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亚 热 带 农 业 研 究第15卷

1 材料与方法

1.1 病样的采集及病原菌的分离纯化

的病害叶片样品ꎬ标记后装入干净样品袋中ꎬ带回实验室进行病原菌的分离ꎮ将组织样品剪成约5mm的组织块ꎬ放置于装有体积分数为75%酒精的烧杯中ꎬ缓慢振荡1minꎬ用灭菌蒸馏水冲洗3次ꎬ用无菌滤纸吸干组织表面水分ꎬ将样品放到马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)培养基(加入0.05g􀅰mL-1链霉素)中ꎬ每皿放置2块ꎮ4~5d后观察纯化平板的菌落是否为纯的单菌落ꎮ若为单菌落ꎬ则纯化完成ꎻ若不是ꎬ则继续纯化ꎬ直至每个平板上的菌落皆为单菌落ꎮ对纯化好的菌落(培养6~7d)进行拍照后ꎬ用体积分数为25%甘油进行保菌ꎬ存于-80℃冰箱备用ꎮ1.2 病原菌致病性测试

取棕竹幼嫩及成熟健康的叶片ꎬ用自来水冲洗3次ꎬ用吸水纸吸干表面水分ꎻ培养皿内铺上湿润的滤纸ꎬ将叶片用接种刀轻轻刮伤表皮形成造伤叶片ꎬ将无造伤和造伤叶片放置于滤纸上ꎻ在每片叶片上接种带孢子的菌丝块(5mm)ꎬ以未接种的叶片作为对照组ꎻ盖好盖子后置于恒温光照培养箱中培养10dꎬ定期观察发病情况并记录结果ꎬ待发病后从病组织处再次分离病原菌ꎮ1.3 病原菌形态学鉴定

对病害叶片进行室内观察ꎬ将具有明显特征的样品(叶片正面或背面可以看见明显的小黑点等颗粒状物质)拿到体视镜(奥林巴斯SZX16)下拍照ꎮ之后进行切片和镜检ꎬ在显微镜(奥林巴斯BX ̄53)下观察该病原菌的形态特征ꎬ并进行拍照和测量ꎬ完成病原菌的初步鉴定ꎮ对供试菌株进行形态观察鉴定ꎬ将分离纯化的菌株进行培养、定期观察并测定生长速率ꎻ当菌丝表面出现橘黄色物质时ꎬ则该菌开始产孢ꎬ此时将菌株在体视镜下拍照ꎻ用挑针挑取产孢结构和适量孢子ꎬ在显微镜下观察菌丝形态、产孢结构、孢子形态特征ꎬ记录并进行拍照和测量ꎮ1.4 病原菌分子生物学鉴定

1.4.1 病原菌DNA的提取及多基因PCR扩增 将供试菌株在PDA培养基上培养5~7dꎬ收集菌丝团块ꎬ冷冻干燥后ꎬ采用DNA快速提取法提取真菌基因组DNA[10]ꎮ并对获得的DNA进行多基因PCR扩增ꎮ钙调蛋白基因(CAL)及几丁质合成酶基因(CHS ̄1)ꎮ扩增引物如表1所示ꎮ扩增后5μLPCR产物加到增产物回收ꎬ并送至上海铂尚生物技术有限公司进行测序ꎮ

扩增基因包括核糖体内转录间隔区基因(ITS)、3 ̄磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、肌动蛋白基因(ACT)、1%琼脂糖凝胶中进行电泳检测ꎮ当条带明亮清晰、无杂带ꎬ且条带大小与所扩基因片段大小相同时ꎬ将扩

Table1 DetailinformationonPCRprimersandthelengthofamplicons

基因ITSGAPDHCALCHS ̄1ACT

引物ITS ̄1FITS ̄4GDFGDR

引物序列(5′-3′)CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAATCCTCCGCTTATTGATATGCGCCGTCAACGACCCCTTCATTGAGAATTCAAGGAGGCCTTCTC

退火56℃/45s60℃/30s56℃/60s58℃/30s56℃/30s

片段长度/bp

560240750250250

2017年7月ꎬ在厦门市植物园、公园和道路绿化带进行棕竹病害调查ꎮ采集有明显黄褐色、黑色斑点

表1 PCR引物及扩增片段长度信息

CL1CCL2CCHS ̄79F

GGGTGGAGTCGTACTTGAGCATGTCTTCTGCATCATGAGCTGGACATGTGCAAGGCCGGTTTCGCTACGAGTCCTTCTGGCCCATTGGGGCAAGGATGCTTGGAAGAAGTGGAAGAACCATCTGTGAGAGTTG

CHS ̄345RACT ̄521FACT ̄783R

1.4.2 DNA序列分析 将获得的供试菌株测序序列用BioEdit软件进行序列修正ꎬ在NCBI(https://

第2期樊改丽:棕竹炭疽病病原菌的分离鉴定

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blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)中进行Blast比对ꎬ得到初步的比对结果ꎮ选用Weiretal[1]鉴定的胶孢炭系统发育进化树的构建和注释[11]ꎮ

疽菌复合种中的模式菌株以及从NCBI比对中选取相应种的序列作为参考序列ꎬ采用MEGA7.0软件进行

2 结果与分析

2.1 病原菌分离及致病性测定

在厦门市植物园、公园和道路绿化带采集大叶棕竹病害样品ꎬ分离纯化出9株单菌株ꎮ9株单菌落菌株在PDA培养基上的生长速度与菌落形态特征一致ꎬ均从叶尖、叶缘及叶片中部发病ꎬ初期为褐色或黑色小斑点ꎬ随后病斑扩展形成不规则形病斑或梭形病斑ꎬ发病中期可见明显的病健交界ꎬ严重时造成叶片缺刻(图1A)ꎮ致病性测定表明ꎬ用菌丝块接种10d后发现造伤接种叶片有明显病斑产生(图1B)ꎬ并能从病斑处分离到与原接种菌一致的菌株ꎬ且所产生的分生孢子与原接种菌株形态、大小一致ꎬ说明供试菌株为棕竹叶斑病的病原菌ꎻ而无伤接种的叶片(CK)未表现病征(图1C)ꎬ说明供试菌株可以从伤口处侵染棕竹叶片ꎮ

A.自然发病ꎻB.造伤叶片发病ꎻC.无伤叶片(CK)ꎮFigure1 LeafsymptomsofR.excelsaanthracnose

图1 棕竹叶片炭疽病症状

2.2 形态学鉴定

  对分离菌株进行形态学特征鉴定ꎮ在PDA平板上ꎬ菌落正面菌丝为白色或灰色绒毛状ꎬ菌落中间菌丝繁茂ꎬ边缘菌丝稀疏ꎻ菌落背面白色、淡褐色、淡黄色ꎮ在光周期12h、28℃条件下培养ꎬ7d后菌落直径为4.4~5.2cm(图2)ꎻ15d后可在菌落表面形成肉眼可见的橘黄色分生孢子堆(图3A)ꎮ显微镜下观察ꎬ分生孢子盘为褐色或灰褐色ꎬ分生孢子梗无色(图3B)ꎻ分生孢子为单孢、无色、长椭圆状、圆柱状、两端稍顿或一端尖顿ꎻ一些孢子内含2个油球ꎻ分生

图2 棕竹炭疽菌在PDA培养基上的菌落生长形态

A.正面ꎻB.背面ꎮ

Figure2 ColonymorphologyofR.excelsaanthracnoseonPDAplate

孢子大小为(12.92~15.63)μm×(4.77~5.84)μmꎬ平均为13.93μm×5.55μmꎬ长宽比为2.51(图3C)ꎮ此鉴定结果与野外采集样品徒手切片鉴定到的菌落菌丝、分生孢子等具有相同的形态学特征ꎮ

A.分生孢子堆ꎻB.分生孢子盘和分生孢子梗ꎻC.分生孢子ꎮ

Figure3 MorphologicalcharacteristicsofR.excelsaanthracnoseconidiophoreheapsandconidiaspores

图3 棕竹炭疽菌菌落孢子堆及孢子形态特征

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2.3 分子生物学鉴定及系统发育分析

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将供试菌株进行ITS基因序列扩增ꎬ并对片段测序ꎬ通过NCBIBlast同源性比对ꎬ发现病原菌株序列与胶孢炭疽菌复合种中的暹罗刺盘孢菌小种序列相似度为100%ꎮ为进一步确定鉴定结果ꎬ本研究选取真菌鉴定常用的ACT、CAL、CHS ̄1和GAPDH共4个单基因序列引物对病原菌进行扩增ꎮ测序结果在NC ̄100%、99.7%、99.2%和100%ꎮ在ITS、ACT、CAL、CHS ̄1和GAPDH5个基因序列的基础上ꎬ通过构建多基因系统发育树ꎬ发现病原菌菌株与暹罗刺盘孢菌株聚为一类(图4)ꎮ结合病原菌菌落特征、显微镜下形态学特征以及分子生物学鉴定结果ꎬ本研究将棕竹炭疽病病原菌鉴定为暹罗刺盘孢菌ꎮ

BI中进行比对表明ꎬACT、CAL、CHS ̄1和GAPDH4个单基因序列与数据库中暹罗刺盘孢菌相似性分别为

图4 基于ITS、ACT、CAL、CHS ̄1和GAPDH基因序列构建的多基因系统发育树

3 讨论与结论

Figure4 PhylogenetictreebasedonthenucleotidesequencesofITSꎬACTꎬCALꎬCHS ̄1andGAPDHgenes

本研究对引起厦门市植物园、公园及道路绿化带的大叶棕竹炭疽病的病原菌进行了分离与鉴定ꎮ病原菌形态学特征观察及单基因与多基因联合的系统发育分析表明ꎬ引起厦门市棕竹炭疽病的病原菌为胶孢炭疽菌复合种小种暹罗刺盘孢菌(C.siamense)ꎮ该病菌可以侵染棕榈科植物棕竹ꎬ造成棕竹炭疽病ꎬ属于国内棕榈科植物中鉴定到暹罗刺盘孢菌的首次报道ꎮ

林业和园林植物由暹罗刺盘孢菌引起的炭疽病研究相对较少ꎮ2017年李沛利等[12]鉴定了暹罗刺盘孢菌可以引起成都市园林观赏植物鹅掌柴的炭疽病ꎻ徐明珠等[13]首次分离鉴定了暹罗刺盘孢菌可引起荆州市香樟树炭疽病ꎮ吴奉奇[14]研究表明ꎬ广东省肇庆市北岭山降香黄檀、樟树、闽楠、火力楠、贝壳杉和格木炭疽病均由暹罗刺盘孢菌引起ꎮ李河等[15]研究发现ꎬ从油茶林及其附近的植被分离到的炭疽菌均可以侵染油茶ꎬ说明不同寄主植物上分离的炭疽菌均可能成为油茶炭疽病的潜在侵染源ꎮ综上表明ꎬ暹罗刺盘孢炭疽菌是一种分布广泛的真菌病害ꎬ在高温高湿的热带和亚热带地区分布更广ꎬ其寄主种类繁多ꎬ可以侵染多种植物从而引起植物炭疽病ꎮ

李沛利等[12]研究发现ꎬ暹罗刺盘孢菌侵染鹅掌柴叶片时ꎬ用砂纸擦拭鹅掌柴叶片更容易致病ꎻ刘威[16]在研究茶树炭疽病时也发现ꎬ暹罗刺盘孢菌通过伤口侵染茶树叶片ꎮ本研究致病性试验发现ꎬ在造伤接种的情况下ꎬ暹罗刺盘孢菌可以成功侵染棕竹ꎮ茶树、鹅掌柴和棕榈科植物叶片蜡质都较厚ꎬ这可能是其不容易侵染的原因ꎮ由此可见ꎬ在棕竹等园林植物栽培过程中ꎬ应尽量减少机械损伤和人为伤害ꎬ修剪枝叶的工具要经常消毒ꎬ以减少病菌侵染的几率和降低病害的流行ꎮ

致谢:福建农林大学植物保护学院胡红莉老师对本研究病原菌测序及鉴定进行指导ꎬ谨此致谢ꎮ

参考文献

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第2期

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樊改丽:棕竹炭疽病病原菌的分离鉴定

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(责任编辑:陈幼玉)  

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